A la différence des encres à base de colorant, les pigments ne se dissolvent pas dans l'eau, mais subsistent sous la forme de petits grains de couleur. Les encres à base de pigments résistent beaucoup mieux aux UV que les encres à base de colorants - sans atteindre la brillance des encres à base de colorants. Par la force des choses, les encres à base de pigments sont utilisées principalement pour des applications en extérieur. Alors que les encres à base de colorants pénètrent dans les matériaux, les pigments se déposent en surface. L'adhésion des pigments reste un problème dans les situations extrêmes.